Если на вашем компьютере установлено две операционные системы, и вы хотите удалить вторую windows, даже при удалении одной из них при загрузке компьютера будет выдавать меню выбора операционных систем. Чтобы удалить ненужную строчку, щелкаем правой кнопкой мыши по значку Мой компьютер, заходим во вкладку Дополнительно и в разделе «Загрузка и восстановление» нажимаем кнопочку Параметры. Тут можно как удалить ненужную, так и сделать загружаемой по умолчанию. Если вы хотите чтобы по умолчанию грузилась одна из них, то просто в выпадающем списке «Операционная система, загружаемая по умолчанию:» выбираем нужную, также должна стоять галочка на пункте «Отображать список операционных систем:».

Если же вы хотите удалить одну из них и оставить только одну ОС, то вам следует отредактировать системный файл boot.ini. Там есть такой пунктик «Отредактировать список загрузки вручную:», нажимаем Правка и в открывшемся файле удаляем ненужную строчку.